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New Method for Cancer Detection
CapturePCR es un método completamente nuevo para el análisis de ctDNA. Evita la laboriosa
y costosa secuenciación de ADN y la bioinformática, y permite una detección rápida
y económica del cáncer. ¿Cómo funciona? Esta diapositiva muestra los fragmentos cromosómicos circulando
en la sangre. Los discos verdes son nucleosomas y los círculos azul claro son moléculas de ctCF.
Cada uno tiene un pequeño trozo de ADN enrollado a su alrededor. El ADN está coloreado de rojo
o amarillo. El ADN rojo son las secuencias de fondo que no nos interesan y el amarillo
son las secuencias objetivo que sí nos interesan. Si se fijan bien, verán que
la persona sana de la izquierda sí tiene las secuencias objetivo amarillas, pero solo unidas
a nucleosomas, no unidos a ctCF. A la derecha, el paciente con cáncer tiene secuencias
de ADN amarillas unidas a ctCF. Así que, si podemos extraer las moléculas de ctCF y
eliminar todos los nucleosomas de fondo, entonces lo que nos queda es esto. En el
lado izquierdo, todas las secuencias de ADN son rojas. Todas son secuencias de fondo. A la derecha, tenemos
secuencias objetivo unidas a ctCF. Si buscamos una secuencia en particular, eso
eliminará todas las demás secuencias no objetivo y obtendremos ADN puro derivado del cáncer. Esta diapositiva
muestra brevemente cómo lo hacemos. Usamos un anticuerpo para extraer todo el ctCF, sin importar
qué fragmento de ADN esté unido a él, y luego extraemos el ADN y lo analizamos para
la secuencia particular que buscamos con una prueba de PCR simple y de bajo costo, la misma prueba
que usarías en principio para la COVID. Nuestros resultados clínicos iniciales para CAPTURE PCR
muestran una detección eficaz de cánceres sólidos y líquidos y en estadios tempranos uno y dos de la enfermedad.
Esto puede allanar el camino para una clase completamente nueva de biomarcadores no descubiertos.
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Original transcript (English)
CapturePCR is a completely new method for analysis of ctDNA. It obviates time-consuming and expensive DNA sequencing and bioinformatics and allows for cost-effective, rapid cancer detection. So how does it work? This slide shows the chromosome fragments circulating in the blood. The green disks are nucleosomes and the light blue circles are ctCF molecules. Each of these has a little piece of DNA wound around it. The DNA is coloured either red
or yellow. The red DNA is the background sequences that we're not interested in and the yellow DNA is the target sequences that we are interested in. If you look carefully, you'll see that the healthy person on the left does have the yellow target sequences, but only attached to nucleosomes, not attached to ctCF. On the right-hand side, the cancer patient has yellow DNA sequences that are attached to ctCF. So if we can pull out the ctCF molecules and
remove all of the background nucleosomes, then what we're left with is this. On the left, all of the DNA sequences are red. They're all background sequences. On the right, we have target sequences attached to ctCF. If we look for a particular sequence, that will remove all the other non-target sequences and we get pure cancer-derived DNA. This slide shows briefly how we do it. We use an antibody to pull out all of the ctCF, regardless of
which DNA fragment is attached to it, and we then extract the DNA and analyse it for the particular sequence we're looking at with a low-cost, simple PCR test, the same test that you would use in principle for COVID. Our initial clinical results for CAPTURE PCR show effective detection of solid and liquid cancers and at early stage 1 and 2 disease. This may pave the way for a whole new class of undiscovered biomarkers.
